Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trat1Q3UU67 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trat1Q3UU67 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms