Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScimpQ3UU41 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ScimpQ3UU41 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms