Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhdc9Q3USL1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhdc9Q3USL1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms