Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28047Q3US59 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms