Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lsg1Q3UM18 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsg1Q3UM18 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms