Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ceacam12Q3UKP4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms