Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc61Q3UJV1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms