Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHU5

Mtcl1, Microtubule cross-linking factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtcl1Q3UHU5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtcl1Q3UHU5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtcl1Q3UHU5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtcl1Q3UHU5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtcl1Q3UHU5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtcl1Q3UHU5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtcl1Q3UHU5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtcl1Q3UHU5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtcl1Q3UHU5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtcl1Q3UHU5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtcl1Q3UHU5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mtcl1Q3UHU5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Mtcl1Q3UHU5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Mtcl1Q3UHU5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Mtcl1Q3UHU5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mtcl1Q3UHU5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mtcl1Q3UHU5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mtcl1Q3UHU5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mtcl1Q3UHU5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mtcl1Q3UHU5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mtcl1Q3UHU5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mtcl1Q3UHU5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mtcl1Q3UHU5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Mtcl1Q3UHU5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mtcl1Q3UHU5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mtcl1Q3UHU5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mtcl1Q3UHU5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mtcl1Q3UHU5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mtcl1Q3UHU5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mtcl1Q3UHU5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Mtcl1Q3UHU5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mtcl1Q3UHU5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mtcl1Q3UHU5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mtcl1Q3UHU5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mtcl1Q3UHU5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mtcl1Q3UHU5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mtcl1Q3UHU5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mtcl1Q3UHU5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms