Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rrp36Q3UFY0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrp36Q3UFY0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms