Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trafd1Q3UDK1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms