Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip13Q3UA06 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms