Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Palb2Q3U0P1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Palb2Q3U0P1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Palb2Q3U0P1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms