Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hace1Q3U0D9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms