Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem88bQ3TYP4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem88bQ3TYP4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms