Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd1Q3TXS7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmd1Q3TXS7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms