Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pbxip1Q3TVI8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pbxip1Q3TVI8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pbxip1Q3TVI8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pbxip1Q3TVI8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pbxip1Q3TVI8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pbxip1Q3TVI8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pbxip1Q3TVI8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pbxip1Q3TVI8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pbxip1Q3TVI8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pbxip1Q3TVI8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pbxip1Q3TVI8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pbxip1Q3TVI8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pbxip1Q3TVI8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pbxip1Q3TVI8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pbxip1Q3TVI8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pbxip1Q3TVI8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pbxip1Q3TVI8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pbxip1Q3TVI8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms