Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt2Q3TTY5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt2Q3TTY5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt2Q3TTY5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt2Q3TTY5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt2Q3TTY5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt2Q3TTY5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt2Q3TTY5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt2Q3TTY5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms