Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctdnep1Q3TP92 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ctdnep1Q3TP92 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms