Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Smarca4Q3TKT4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Smarca4Q3TKT4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms