Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2afvQ3THW5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.5 ms