Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RubcnlQ3TD16 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RubcnlQ3TD16 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms