Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Jmjd8Q3TA59 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms