Protein–RNA interactions for Protein: Q31615

H2-T22, Histocompatibility 2, T region locus 22, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T22Q31615 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-T22Q31615 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-T22Q31615 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms