Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Spatc1Q148B6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Spatc1Q148B6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Spatc1Q148B6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Spatc1Q148B6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Spatc1Q148B6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spatc1Q148B6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms