Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Znf541Q0GGX2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms