Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms