Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnma1Q08460 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms