Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff1Q08423 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff1Q08423 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff1Q08423 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff1Q08423 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff1Q08423 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff1Q08423 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff1Q08423 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff1Q08423 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff1Q08423 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff1Q08423 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff1Q08423 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms