Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms