Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Calb2Q08331 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms