Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MestQ07646 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MestQ07646 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MestQ07646 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MestQ07646 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MestQ07646 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MestQ07646 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MestQ07646 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MestQ07646 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MestQ07646 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MestQ07646 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MestQ07646 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MestQ07646 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MestQ07646 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MestQ07646 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MestQ07646 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MestQ07646 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MestQ07646 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MestQ07646 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MestQ07646 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MestQ07646 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MestQ07646 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MestQ07646 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MestQ07646 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MestQ07646 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MestQ07646 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MestQ07646 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MestQ07646 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MestQ07646 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MestQ07646 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MestQ07646 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MestQ07646 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MestQ07646 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MestQ07646 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MestQ07646 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MestQ07646 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MestQ07646 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MestQ07646 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MestQ07646 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MestQ07646 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MestQ07646 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MestQ07646 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MestQ07646 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MestQ07646 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MestQ07646 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MestQ07646 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MestQ07646 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MestQ07646 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MestQ07646 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MestQ07646 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MestQ07646 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MestQ07646 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MestQ07646 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MestQ07646 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MestQ07646 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MestQ07646 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MestQ07646 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MestQ07646 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MestQ07646 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MestQ07646 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MestQ07646 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MestQ07646 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MestQ07646 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MestQ07646 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MestQ07646 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MestQ07646 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MestQ07646 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MestQ07646 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MestQ07646 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MestQ07646 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MestQ07646 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MestQ07646 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MestQ07646 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MestQ07646 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MestQ07646 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MestQ07646 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MestQ07646 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MestQ07646 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MestQ07646 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MestQ07646 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MestQ07646 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MestQ07646 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MestQ07646 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MestQ07646 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MestQ07646 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MestQ07646 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MestQ07646 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MestQ07646 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MestQ07646 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MestQ07646 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MestQ07646 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MestQ07646 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MestQ07646 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MestQ07646 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MestQ07646 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MestQ07646 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MestQ07646 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MestQ07646 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MestQ07646 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MestQ07646 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms