Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NrepQ07475 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NrepQ07475 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NrepQ07475 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms