Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Fmn1Q05860 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Fmn1Q05860 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Fmn1Q05860 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Fmn1Q05860 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Fmn1Q05860 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Fmn1Q05860 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Fmn1Q05860 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Fmn1Q05860 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Fmn1Q05860 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Fmn1Q05860 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Fmn1Q05860 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Fmn1Q05860 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Fmn1Q05860 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Fmn1Q05860 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Fmn1Q05860 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Fmn1Q05860 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Fmn1Q05860 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Fmn1Q05860 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms