Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox9Q04887 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox9Q04887 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms