Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scg2Q03517 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scg2Q03517 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms