Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl7Q03366 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms