Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.1 ms