Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nhlh1Q02576 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nhlh1Q02576 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms