Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr1fQ02284 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htr1fQ02284 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms