Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cacna1cQ01815 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms