Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EgfrQ01279 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EgfrQ01279 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms