Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HmgcrQ01237 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HmgcrQ01237 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms