Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoa1Q00623 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms