Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gabpb1Q00420 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gabpb1Q00420 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms