Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx2Q00262 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx2Q00262 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx2Q00262 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms