Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gbp10Q000W5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp10Q000W5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms