Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lama4P97927 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lama4P97927 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lama4P97927 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Lama4P97927 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lama4P97927 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lama4P97927 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lama4P97927 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lama4P97927 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms