Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pkp1P97350 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms