Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhodP97348 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhodP97348 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhodP97348 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhodP97348 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhodP97348 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhodP97348 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhodP97348 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhodP97348 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhodP97348 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhodP97348 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhodP97348 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RhodP97348 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RhodP97348 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhodP97348 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhodP97348 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhodP97348 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhodP97348 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhodP97348 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhodP97348 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RhodP97348 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhodP97348 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhodP97348 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhodP97348 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhodP97348 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhodP97348 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhodP97348 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhodP97348 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhodP97348 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhodP97348 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhodP97348 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhodP97348 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhodP97348 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhodP97348 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RhodP97348 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhodP97348 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhodP97348 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhodP97348 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhodP97348 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhodP97348 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhodP97348 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhodP97348 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RhodP97348 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhodP97348 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhodP97348 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhodP97348 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhodP97348 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhodP97348 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhodP97348 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhodP97348 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhodP97348 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhodP97348 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhodP97348 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhodP97348 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhodP97348 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhodP97348 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhodP97348 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RhodP97348 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhodP97348 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhodP97348 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhodP97348 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhodP97348 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhodP97348 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhodP97348 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhodP97348 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhodP97348 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhodP97348 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhodP97348 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhodP97348 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhodP97348 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhodP97348 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhodP97348 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhodP97348 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhodP97348 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhodP97348 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhodP97348 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhodP97348 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhodP97348 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhodP97348 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms