Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nkx2-3P97334 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx2-3P97334 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms